Secondo le analisi dell'International Crisis Group, gruppo di esperti che si occupa di monitorare le situazioni di crisi, ci sono attualmente ventisei conflitti in corso nel mondo.

Le situazioni di conflitto, strisciante o aperto, nelle quali MCO si trova ad operare sono molteplici e complesse. A volte gli interventi sono direttamente legati con la risoluzione del conflitto, come nel caso delle Escuelas de perdón y reconciliación (Espere) in Colombia.

In altri casi, la gestione dei contesti conflittuali si traduce in un impegno di MCO a fianco delle popolazioni indigene che lottano per l'affermazione dei propri diritti in realtà ostili, come nel caso del Roraima (Brasile).

Vi sono poi realtà in cui la consapevolezza di operare in un contesto caratterizzato dal conflitto permea di sé i progetti e la presenza stessa di MCO nell'area. È questo il caso del Kenya, dove MCO lavora con le popolazioni indigene Samburu e Turkana e promuove il dialogo inter-religioso.